Konfiguracja Joystika (ang. Joystick Config) jest menu dostępnym z menu Start. Opcja, aby wejść do tego menu pojawia się tylko wtedy, kiedy regulator jest podłączony do komputera podczas, gdy Undertale się uruchamia.
W tym menu, gracz ma kilka opcji, gdzie może manipulować gamepadem, zamiast klawiatury. To menu zawiera także test kontrolny do sprawdzania, czy przyciski zostały zainstalowane poprawnie.
Opcje[]

Test kontrolny
W kolejności, w jakiej opcje pojawiają się w menu, podane są w następujący sposób:
- Wyjście.
- Potwierdź - [Z lub Enter], Anuluj - [X lub Shift], menu - [C lub CTRL]: Opcje te pozwalają graczowi wybrać 3 przyciski na gamepadzie do potwierdzenia, anulowania i Menu.
- Analogowa Czułość: Ta opcja pozwala graczowi dostosować czułość drążka analogowego.
- Przywróć ustawienia domyślne.
- Próba kontrolna: Ta wprowadza gamepad do badania kontrolnego.
Alternatywna wersja[]
- Annoying Dog się nie pojawia.
- Nie ma żadnej muzyki.
- Brak efektów sezonowych.
- Drzewa i domy się nie pojawiają. [Test kontrolny]
- Brak efektów dźwiękowych po naciśnięciu różnych przycisków. [Test kontrolny]